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AI 延续学内容库

固定上游版本 · GitHub 临时运行器真实试跑 · 无个人资料上传

methylclock:先看甲基化位点覆盖率,再谈时钟计算

DNA 甲基化 beta 矩阵可以用于研究性年龄时钟计算,但不是把任意一张表扔进去就有可信结果。 本页给已有研究数据、正在挑工具的读者一个可复核的小实验:固定 作者仓库开发版 1.99.2,先核对三个时钟所需 CpG 是否存在,只为其中一个时钟计算聚合结果。 本站不提供个人年龄检测,也不收用户的甲基化数据。

这次跑出来的结果

2026-09-30 的真实运行成功。输入是作者随包提供的 919 个 CpG × 16 个样本 的 beta 矩阵,不是合成随机表,也不是网站访客的健康资料。初次安装依赖约花 20 分钟;真正的覆盖核对和计算约 15 秒。

这批样本中的位点覆盖
时钟 需用 CpG 找到 CpG 覆盖
Horvath353353100%
Levine513513100%
Wu111111100%

仅 Horvath 时钟做了进一步试算:16 个样本均得到有限数值,模型输出中位数 25.2197。这是模型数字,不是已知真实年龄的误差或临床“生物年龄”。 本次样本没有逐人的真实年龄和结局,不能推导准确率、延寿疗效或个人建议。

运行页底部的 methylclock-public-summary 工件仅保存聚合 JSON 7 天; 不公开 16 人逐样本预测、beta 矩阵或时钟系数。工件过期后仍可查看运行日志并在自己的副本重新执行。

新手怎样自己复跑

  1. 登录 GitHub,打开本站开源仓库,点击右上角 Fork 创建副本。普通访客不能在本站原仓库运行任务。
  2. 在你自己的副本的 Actions 中启用工作流,找到 Public-data methylclock coverage trial,点击 Run workflow。 它只在手动触发时运行,不要求输入资料、密钥或付款。
  3. 第一次安装 R/Bioconductor 和 C++ 依赖会较慢。等待任务绿色勾后,打开运行页底部 methylclock-public-summary,核对固定上游提交 30be0284066fda7d2f81ec4bf427da56f0f89d1b、 coverage 三行和 horvath_finite_outputs 是否为 16。 如果失败,先区分安装、下载系数、覆盖率与结果校验四个步骤;不要把红叉当成生物学结论。

工作流源码固定版本、限制只读权限与 40 分钟上限; R 脚本断言样本形状和覆盖率,只写聚合结果。 若换自己的研究矩阵,须在自己的受控环境中确认样本来源、探针编号、组织适用范围与权限; 本站的固定公开样本工作流不接收上传。

跑不通?附公开运行链接反馈问题,不要贴个人健康资料、API Key 或系数文件。